Początek działalność Sekcji datuje się na sierpień 1960 roku. Powstała ona z inicjatywy Adama Święca, Wiesława Sawickiego, Kazimierza Jaremczaka oraz ówczesnego Kierownika Klubu kmdr. por. Stanisława Filipiaka. Duży wpływ na powstanie Sekcji miało także poparcie Wydziału Wychowania Fizycznego i Sportu Dowództwa. Marynarki Wojennej, dążącego do rozwijania sportów walki i samoobrony. Dopiero w 1961 roku przydzielono pierwszą dotację z Klubu, która przyczyniła się do stworzenia podstaw organizacyjno-szkoleniowych gwarantujących sprawne działanie Sekcji.
Sekcja realizuje zadanie: "Sportowe szkolenie dzieci i młodzieży z terenu Gdyni w judo" - współfinansowane ze środków Miasta Gdynia
